中心由行政办公室、教学办公室、企业资源规划教研室、企业仿真教研室、实验教学资源开发部和资产管理维护部组成。行政办公室负责中心日常行政工作开展,主要做好中心内外来访人员的接待、对外宣传和联络工作;教学办公室负责日常教务工作,包括协助领导完成教学计划制订,负责教学计划执行表的制订及课程表编排工作,负责教学活动的协调与管理、办理调、停课手续;企业资源规划教研室和企业仿真教研室由相关专职教师和各个院系的精英教师组成,在中心主任的领导下,具体负责中心课程建设规划、教学计划、教学大纲制定和教学实施;实验教学资源开发部负责虚拟仿真实验教学平台的资源开发和建设;资产管理维护部负责实验室安全、实验设备使用维护,以及实验室建设的辅助等工作。中心组织结构图如图所示。